Seperti medikasi pada umumnya, PrEP juga bisa menimbulkan efek samping ringan seperti mual, diare, atau sakit kepala pada beberapa orang, terutama di minggu-minggu awal penggunaan. Namun efek ini biasanya bersifat sementara dan bisa diatasi.
Yang paling penting, pengguna PrEP perlu menjalani
tes HIV secara berkala dan memastikan untuk tidak melewatkan dosis harian. Konsumsi yang tidak konsisten dapat mengurangi efektivitas dan meningkatkan risiko resistensi.