Kelainan pada kulit genital memiliki banyak kemungkinan penyebab. Beberapa IMS bahkan dapat menimbulkan lesi yang sekilas menyerupai jerawat, bisul, luka, atau benjolan.
Herpes genital, misalnya, umumnya menimbulkan satu atau beberapa lepuhan di sekitar genital, rektum, atau mulut. Lepuhan tersebut dapat pecah dan meninggalkan luka yang terasa nyeri. Pada gejala yang ringan, herpes bahkan bisa keliru dianggap sebagai jerawat atau rambut yang tumbuh ke dalam.
Sementara itu, sifilis primer biasanya ditandai dengan satu atau beberapa luka pada lokasi masuknya bakteri. Luka tersebut sering berbentuk bulat, relatif keras, dan tidak terasa sakit, walaupun manifestasinya dapat bervariasi.
Kondisi lain adalah kutil kelamin akibat HPV. Kutil genital dapat tampak sebagai satu benjolan atau sekumpulan benjolan yang kecil maupun besar, datar, menonjol, atau menyerupai kembang kol.
Perbedaan tersebut menunjukkan bahwa lokasi benjolan saja tidak cukup untuk menentukan diagnosis. Pemeriksaan dokter diperlukan terutama ketika bentuk lesi tidak khas, muncul setelah aktivitas seksual berisiko, atau disertai keluhan genital lainnya.